确立了权利和义务之后，接下来的就是政府机构改革了。首先改革的就是礼部。过去的礼部太混沌了，胡子眉毛一把抓。权责不明。改革首当其冲就是礼部，首先保留了礼部这个称谓，但是其职能变得非常单一，就管一些礼仪上的事情。祭祀、祭天之类的仪式，都归礼部管。其他的只能部门被分离出来，增加理藩部、教育部这两个部门。第二个改革的部门是刑部。分割成检察部、警察部。一个负责查案，一个负责审核批捕。工部分成了工业部、格物部（科技部）、水利部，本来还打算城里一个地质部，结果一想土地矿山都是私人的，就算是公家的最终也是由私人去开发。就不用多出这么一个部门浪费公帑了。都察院、大理寺被取消，以部门纳入皇帝直属的宣传部，这是朱慈烺为自己争取的一个重要的砝码。有了这个部门在手里，今后办个报纸就得由宣传部门批准不，你还得交管理费。就这个部门，还是国家出钱养着，皇权不能什么都落不下吧？对于这个事情，陈燮没坚持，他要就给他了。反正今后跟皇帝较劲是的建新政府，陈燮呆不了多久，五年就得闪人。在一个就是大理寺，直接取消了，审案今后是法院的事情，立案、查案是警察的事情，核准、批捕、搜查令是检察院的事情，还留着这么一个机构干
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