王朝身于哈布斯堡家族的腓力一世与卡斯蒂利亚的女王胡安娜（疯女胡安娜）之子，阿拉贡的斐迪南二世与卡斯蒂利亚的伊莎贝拉一世的外孙，神圣罗马帝国皇帝马克西米连一世和勃艮第公国女公爵玛丽的孙子。他生于根特并在低地国家被抚养长大，他童年时的教师是乌得勒支的艾德里安，也就是日后的教皇哈德良六世......
    除此之外，查理五世的具体国籍是很难说明白的：从父方来看，他是奥地利哈布斯堡王朝的一员，但他却不是纯粹的日耳曼血统；从母方来看，他的母亲是西班牙人，西班牙也是他庞大帝国的核心，但他在西班牙却经常感到自己是一个外来者；他的母语是法语，那是他长大的地方“低地国家”（那时候的低地国家包括今天的比利时、卢森堡、荷兰与法国的北部·加莱海峡大区）的贵族们通用的语言，然而法国却正是他终生的敌人。
    从他的庞大帝国的建立过程中来看，这个流程不能不说跟开挂了有些类似：查理五世于一五零六年也就是他的父亲去世那一年继承了低地国家和弗朗什孔泰，而在他强悍的外祖父斐迪南二世在一五一六年去世后，他也顺理成章地成为一片巨大领地的拥有者，这片领地包括他母亲的卡斯蒂利亚与斐迪南二世统治的阿拉贡王国、卡斯蒂利亚
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