31年12月1日，民国政府总统汤化龙颁布政令，鉴于军事委员会已经完成其历史使命，继续存在将阻碍国家的军事发展，即日起取消该委员会。该政令同时宣布，没有国会的半数以上通过，任何人无权宣布对外战争。原国家军事委员会委员长方剑雄元帅，在政令颁布的第二天，宣布退出军界，加入共和党。12月25日，共和党全党代表大会在北京举行，以全票通过方剑雄当选共和党党魁，汤化龙荣膺名誉党魁。
    取消军事委员会之后，民国政府以国防部总领军事，下设总参谋部、总后勤部、总装备部、总预备役部。总参总领三军作战事宜，海军、陆军、空军分别设总指挥部，接受总参、国防部两级管理。国防部长、副部长、总参谋长分别由蔡锷、蒋方震出任、张孝淮。刘冠雄任海军总司令，下辖海军作战舰艇部队、海军陆战队以及海军航空兵部队，陆军总司令由齐正鸿出任，下辖地面作战部队以及陆军航空兵序列，空军司令冯如。
    此政令再次推进了军队国家化的进城，从根子上彻底的切断了军阀割据的可能性。有趣的是，这一由方剑雄主动发起并推进的政令，居然成了国民党、统一党等在野党自我吹嘘的钱。各党报纸纷纷自诩，正是犹豫他们孜孜不倦的呼吁，才使得军事委员会这一
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